| Организация | Всего 2008 | Июнь 2009 | Июль 2009 | Всего 2009 |
| Зональная научная библиотека им. В.А.Артисевич Саратовского госуниверситета | 804 | 75 | 681 | 7886 |
| Научная библиотека МГУ им. Ломоносова | 14673 | 951 | 663 | 6673 |
| Институт цитологии РАН | 2993 | 403 | 302 | 5680 |
| Библиотека по естественным наукам РАН | 3546 | 654 | 260 | 3100 |
| Физико-технический институт им. А.Ф. Иоффе Российской академии наук | 3418 | 505 | 397 | 3049 |
| Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН | 4083 | 674 | 268 | 2890 |
| Государственная публичная научно-техническая библиотека Сибирского отделения РАН | 3260 | 271 | 209 | 2002 |
| Санкт-Петербургский государственный университет | 2255 | 216 | 129 | 1772 |
| Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН | 2704 | 185 | 191 | 1495 |
| Институт физики микроструктур Российской Академии наук | 2128 | 155 | 211 | 1329 |
| Институт Проблем Химической Физики РАН | 1481 | 133 | 243 | 1252 |
| Институт цитологии и генетики Сибирского Отделения Российской Академии Наук | 812 | 172 | 106 | 1182 |
| Московский физико-технический институт (государственный университет) | 402 | 156 | 114 | 997 |
| Институт биофизики СО РАН | 825 | 107 | 134 | 869 |
| Институт вычислительного моделирования Сибирского отделения Российской академии наук | 870 | 100 | 134 | 828 |
| Институт физики полупроводников СО РАН | 0 | 68 | 36 | 746 |
| Арктический и Антарктический научно-исследовательский институт | 646 | 85 | 71 | 746 |
| Институт химической физики им. Н.Н.Семенова Российской академии наук | 646 | 85 | 71 | 746 |
| Казанский государственный университет им. В.И.Ульянова-Ленина | 918 | 112 | 30 | 734 |
| Научно-исследовательский институт комплексных испытаний оптико-электронных приборов и систем | 975 | 56 | 65 | 730 |
| Казанский научный центр Российской академии наук | 690 | 447 | 16 | 728 |
| Тихоокеанский институт биоорганической химии ДВО РАН | 531 | 145 | 99 | 728 |
| МИФИ | 1326 | 67 | 94 | 710 |
| Институт Физики Твердого Тела Российской Академии Наук | 1070 | 140 | 42 | 709 |
| Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН | 0 | 134 | 143 | 703 |
| Уфимский государственный авиационный технический университет | 586 | 37 | 339 | 653 |
| Красноярский научный центр Сибирского отделения РАН | 133 | 89 | 88 | 600 |
| Научный центр волоконной оптики РАН | 1238 | 102 | 68 | 578 |
| Объединенный институт ядерных исследований | 875 | 37 | 31 | 543 |
| Нижегородский государственный университет им. Н.И.Лобачевского | 322 | 93 | 45 | 528 |
| Российский научный центр "Курчатовский институт" | 0 | 96 | 53 | 518 |
| Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н.Северцова | 555 | 73 | 73 | 501 |
| Воронежский государственный университет | 587 | 119 | 71 | 440 |
| Южный федеральный университет | 580 | 72 | 75 | 439 |
| Нижегородский государственный технический университет им. Р.Е.Алексеева | 26 | 0 | 45 | 435 |
| Институт проблем технологии микроэлектроники и особо чистых материалов РАН | 8 | 53 | 22 | 426 |
| Санкт-Петербургский государственный политехнический университет | 534 | 81 | 25 | 419 |
| Белгородский государственный университет | 341 | 40 | 84 | 415 |
| Петербургский институт ядерной физики им. Б.П.Константинова РАН | 475 | 31 | 55 | 409 |
| Институт Ядерной Физики СО РАН | 0 | 41 | 79 | 387 |
| Институт радиотехники и электроники Российской Академии наук | 420 | 52 | 65 | 381 |
| ФГУП НИЦ “Строительство”, Научно-исследовательский институт бетона и железобетона (НИИЖБ) | 72 | 54 | 14 | 369 |
| Институт автоматики и электрометрии СО РАН | 255 | 54 | 50 | 367 |
| Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН | 365 | 37 | 24 | 363 |
| Институт молекулярной биологии им. В.А.Энгельгардта | 0 | 55 | 64 | 362 |
| Институт теоретической и прикладной механики им. С.А.Христиановича СО РАН | 434 | 33 | 105 | 352 |
| Иркутский научный центр СО РАН | 264 | 33 | 22 | 346 |
| Институт неорганической химии им. А.В.Николаева Cибирского отделения Российской академии наук | 13 | 59 | 20 | 343 |
| Институт катализа им. Г.К.Борескова СО РАН | 0 | 31 | 30 | 334 |
| Томский государственный университет | 419 | 44 | 58 | 327 |
| Биолого-почвенный институт ДВО РАН | 435 | 13 | 52 | 325 |
| Всероссийский институт научной и технической информации РАН | 357 | 11 | 131 | 317 |
| Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук | 258 | 40 | 66 | 290 |
| Вятский государственный университет | 343 | 10 | 54 | 262 |
| Уральский государственный университет им. А.М.Горького | 289 | 20 | 8 | 253 |
| Омский государственный университет им. Ф.М.Достоевского | 0 | 213 | 22 | 248 |
| Научно-исследовательский институт физико-химической медицины, Федеральное агентство по здравоохранению и социальному развитию | 235 | 68 | 30 | 222 |
| Институт органической химии им. Н.Д.Зелинского РАН | 119 | 6 | 8 | 221 |
| Физико-технологический институт Российской Академии наук | 314 | 85 | 31 | 217 |
| Российская государственная библиотека | 99 | 26 | 56 | 217 |
| Научно-исследовательский физико-химический институт им. Л.Я.Карпова | 126 | 37 | 21 | 215 |
| Томский политехнический университет | 117 | 33 | 2 | 214 |
| Государственная публичная научно-техническая библиотека России | 84 | 4 | 30 | 210 |
| Институт физики высоких давлений им. Л.Ф.Верещагина РАН | 282 | 45 | 19 | 206 |
| Институт физики молекул и кристаллов Уфимского научного центра Российской академии наук | 140 | 39 | 16 | 204 |
| Сибирский федеральный университет | 136 | 34 | 13 | 202 |
| Санкт-Петербургский государственный университет информационных технологий, механики и оптики | 313 | 47 | 7 | 189 |
| Объединенный институт высоких температур Российской академии наук | 128 | 106 | 0 | 180 |
| Институт органической и физической химии им. А.Е.Арбузова Казанского научного центра Российской академии | 0 | 11 | 15 | 178 |
| Научно-исследовательский институт прикладной акустики | 14 | 6 | 15 | 170 |
| Южно-уральский государственный университет | 3 | 17 | 9 | 163 |
| Институт гидродинамики им. М.А.Лаврентьева СО РАН | 163 | 29 | 29 | 160 |
| Палеонтологический институт РАН | 177 | 15 | 14 | 158 |
| Центр "БИОИНЖЕНЕРИЯ" Российской академии наук | 303 | 21 | 18 | 158 |
| Государственная корпорация Российские нанотехнологии | 0 | 21 | 4 | 155 |
| Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН | 197 | 12 | 18 | 153 |
| Институт математических проблем биологии РАН | 369 | 4 | 30 | 149 |
| Институт химической кинетики и горения Сибирского отделения Российской академии наук | 241 | 6 | 14 | 144 |
| Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека | 92 | 39 | 4 | 143 |
| Государственный университет - Высшая школа Экономики | 143 | 25 | 3 | 131 |
| Волгоградский государственный технический университет | 16 | 14 | 4 | 131 |
| Институт физиологически активных веществ РАН (ИФАВ РАН) | 75 | 15 | 22 | 127 |
| Институт физики атмосферы им. А.М.Обухова РАН | 169 | 50 | 9 | 126 |
| Российский химико-технологический университет им. Д.И.Менделеева | 98 | 11 | 4 | 125 |
| Томский государственный университет систем управления и радиоэлектроники | 48 | 5 | 2 | 122 |
| Новосибирский государственный университет | 188 | 2 | 10 | 115 |
| Сургутский государственный университет Ханты-Мансийского автономного округа - Югры | 63 | 0 | 0 | 112 |
| Институт сильноточной электроники СО РАН | 110 | 15 | 15 | 106 |
| Свердловская областная универсальная научная библиотека им. В.Г.Белинского | 250 | 11 | 22 | 103 |
| Ульяновский государственный университет | 37 | 5 | 13 | 102 |
| Институт теплофизики им. С.С.Кутателадзе СО РАН | 224 | 13 | 2 | 100 |
| Коми научный центр Уральского отделения Российской академии наук | 78 | 7 | 14 | 97 |
| Научный центр психического здоровья РАМН | 76 | 26 | 14 | 93 |
| Центр геоэлектромагнитных исследований института физики Земли им. О.Ю.Шмидта Российской академии наук | 202 | 0 | 0 | 91 |
| Институт оптики атмосферы СО РАН | 107 | 23 | 6 | 89 |
| Институт лазерной физики СО РАН | 80 | 18 | 11 | 88 |
| Самарский государственный университет | 81 | 13 | 0 | 87 |
| Центр фотохимии Российской академии наук | 45 | 10 | 20 | 87 |
| Московский государственный технический университет им. Н.Э.Баумана | 130 | 13 | 2 | 86 |
| Ордена Ленина и Ордена Октябрьской революции Институт геохимии и аналитической химии им. В.И.Вернадского Российской академии наук | 119 | 3 | 9 | 85 |
| Институт химии растворов РАН | 2 | 6 | 9 | 82 |
| Технологический Институт Сверхтвердых и Новых Углеродных Материалов | 0 | 7 | 6 | 81 |
| Институт экспериментальной минералогии РАН | 104 | 3 | 3 | 80 |
| Институт геологии рудных месторождений, петрографии, минералогии и геохимии РАН | 0 | 4 | 7 | 77 |
| Институт земного магнетизма, ионосферы и распространения радиоволн им. Н.В. Пушкова РАН | 0 | 2 | 1 | 76 |
| Российский Федеральный Ядерный Центр - Всероссийский Научно-Исследовательский Институт Технической Физики им академ. Е.И. Забабахина | 193 | 6 | 10 | 66 |
| Российский государственный педагогический университет им. А.И.Герцена | 31 | 2 | 0 | 65 |
| Институт химии твердого тела и механохимии СО РАН | 117 | 5 | 2 | 64 |
| Пермский государственный университет | 0 | 3 | 0 | 61 |
| Пермский государственный технический университет | 0 | 11 | 2 | 61 |
| Новосибирский институт органической химии им. Н.Н.Ворожцова СО РАН | 73 | 14 | 4 | 60 |
| Российский университет дружбы народов | 102 | 5 | 0 | 57 |
| Тихоокеанский океанологический институт им. В.И.Ильичева ДВО РАН | 143 | 1 | 4 | 57 |
| Институт физики прочности и материаловедения СО РАН | 190 | 4 | 7 | 57 |
| Институт Теоретической и Экспериментальной физики | 79 | 19 | 10 | 57 |
| Российская национальная библиотека | 55 | 3 | 2 | 55 |
| Петрозаводский государственный университет | 67 | 2 | 9 | 50 |
| Институт биологии внутренних вод им. И.Д.Папанина РАН | 73 | 12 | 6 | 47 |
| Институт Нефтехимического синтеза им А.В.Топчиева РАН | 144 | 9 | 3 | 46 |
| Институт металлоорганической химии им. Г.А.Разуваева Российской академии наук | 160 | 3 | 0 | 41 |
| Тверской государственный университет | 15 | 0 | 31 | 41 |
| Институт химии и химической технологии СО РАН | 10 | 2 | 0 | 39 |
| Калмыцкий государственный университет | 66 | 0 | 0 | 38 |
| Библиотека Российской академии наук | 137 | 29 | 1 | 32 |
| Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора | 104 | 18 | 2 | 31 |
| Институт механики сплошных сред Уральского отделения Российской Академии наук | 0 | 7 | 5 | 31 |
| Всероссийский НИИ сельскохозяйственной радиологии и агроэкологии | 0 | 0 | 13 | 29 |
| Южно-Российский государственный технический университет (Новочеркасский политехнический институт) | 8 | 4 | 5 | 28 |
| Институт вулканологии и сейсмологии ДВО РАН | 115 | 7 | 1 | 24 |
| Удмуртский государственный университет | 66 | 6 | 0 | 23 |
| Международный университет природы, общества и человека "Дубна" | 35 | 4 | 3 | 23 |
| Нижегородская государственная медицинская академия | 20 | 0 | 0 | 14 |
| Институт технической химии Уральского отделения Российской академии наук | 75 | 3 | 0 | 13 |
| Институт химии нефти Сибирского отделения Российской академии наук | 49 | 0 | 0 | 11 |
| Томский государственный педагогический университет | 16 | 2 | 0 | 11 |
| Тульский государственный университет | 0 | 0 | 1 | 11 |
| Национальная библиотека Республики Карелия | 152 | 3 | 2 | 11 |
| Институт физики им. Л.В.Киренского СО РАН | 38 | 4 | 0 | 9 |
| Северо-Кавказский государственный технический университет | 0 | 0 | 0 | 7 |
| Дальневосточный государственный технический университет (ДВПИ имени В.В. Куйбышева) | 2 | 0 | 7 | 7 |
| Институт проблем сверхпластичности металлов РАН | 23 | 2 | 0 | 6 |
| Нижегородский государственный технический университет им. Р.Е.Алексеева | 0 | 2 | 2 | |
| Институт экспериментальной и теоретической биофизики РАН. См Ин-т теоретической и экспериментальной биофизики | 403 | 0 | 0 | 0 |
| Ижевская государственная сельскохозяйственная академия | 0 | 0 | 0 | 0 |
| Кабардино-Балкарский государственный университет | 0 | 0 | 0 | |
| Центральная научная библиотека ДВО РАН | 2618 | 0 | 0 | |
| Всего НЭИКОН | 72716 | 9349 | 7527 | 70630 |